Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HHIPQ96QV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHIPQ96QV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHIPQ96QV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms