Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCEEQ96PE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCEEQ96PE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms