Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC6Q96NY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC6Q96NY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC6Q96NY7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC6Q96NY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIC6Q96NY7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms