Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSNARE1Q96NA8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1Q96NA8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1Q96NA8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms