Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM56Q96MV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM56Q96MV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM56Q96MV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM56Q96MV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM56Q96MV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms