Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM3Q96MP5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM3Q96MP5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM3Q96MP5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM3Q96MP5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms