Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSMCE2Q96MF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE2Q96MF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms