Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT6LQ96LI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNOT6LQ96LI5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT6LQ96LI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms