Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFRQ96KR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFRQ96KR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFRQ96KR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms