Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87BQ96K49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM87BQ96K49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM87BQ96K49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms