Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC16BQ96JE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16BQ96JE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC16BQ96JE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms