Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22AQ96IW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms