Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3IP1Q96FE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3IP1Q96FE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3IP1Q96FE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms