Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C18orf8Q96DM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C18orf8Q96DM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms