Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RMDN1Q96DB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN1Q96DB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN1Q96DB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms