Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLCD1Q96CP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLCD1Q96CP7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms