Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TIFAQ96CG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TIFAQ96CG3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms