Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TIFAQ96CG3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIFAQ96CG3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TIFAQ96CG3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TIFAQ96CG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TIFAQ96CG3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms