Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NSUN4Q96CB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NSUN4Q96CB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NSUN4Q96CB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms