Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUNDC1Q96C34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RUNDC1Q96C34 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RUNDC1Q96C34 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RUNDC1Q96C34 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RUNDC1Q96C34 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RUNDC1Q96C34 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms