Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMIGD2Q96BF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD2Q96BF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms