Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC74AQ96AQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC74AQ96AQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC74AQ96AQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms