Protein–RNA interactions for Protein: Q96A25

TMEM106A, Transmembrane protein 106A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106AQ96A25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM106AQ96A25 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106AQ96A25 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM106AQ96A25 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms