Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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