Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY2Q8WXA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY2Q8WXA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUFY2Q8WXA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms