Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LMBR1Q8WVP7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1Q8WVP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1Q8WVP7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms