Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACER1Q8TDN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACER1Q8TDN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ACER1Q8TDN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACER1Q8TDN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACER1Q8TDN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACER1Q8TDN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms