Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF398Q8TD17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF398Q8TD17 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF398Q8TD17 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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