Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD16

BICD2, Protein bicaudal D homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD2Q8TD16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD2Q8TD16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD2Q8TD16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD2Q8TD16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BICD2Q8TD16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BICD2Q8TD16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD2Q8TD16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD2Q8TD16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD2Q8TD16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD2Q8TD16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD2Q8TD16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms