Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF548Q8NEK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF548Q8NEK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF548Q8NEK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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