Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM3Q8NE01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNNM3Q8NE01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNNM3Q8NE01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM3Q8NE01 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms