Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EHBP1Q8NDI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EHBP1Q8NDI1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHBP1Q8NDI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms