Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDPRQ8NCN5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDPRQ8NCN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms