Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDH13Q8NBN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RDH13Q8NBN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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