Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD1Q8N9Z9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD1Q8N9Z9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD1Q8N9Z9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms