Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX31Q8N9S9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX31Q8N9S9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX31Q8N9S9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX31Q8N9S9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms