Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PACRGLQ8N7B6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACRGLQ8N7B6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACRGLQ8N7B6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACRGLQ8N7B6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms