Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF10Q8N5U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF10Q8N5U6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF10Q8N5U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF10Q8N5U6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF10Q8N5U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF10Q8N5U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF10Q8N5U6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms