Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM20Q8N5G0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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