Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO39Q8N4B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO39Q8N4B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO39Q8N4B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO39Q8N4B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO39Q8N4B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO39Q8N4B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms