Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNE4Q8N205 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNE4Q8N205 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNE4Q8N205 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNE4Q8N205 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms