Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYS1

PM20D2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PM20D2Q8IYS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PM20D2Q8IYS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PM20D2Q8IYS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PM20D2Q8IYS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PM20D2Q8IYS1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PM20D2Q8IYS1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PM20D2Q8IYS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PM20D2Q8IYS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms