Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXR5

FAM178B, Protein FAM178B, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM178BQ8IXR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FAM178BQ8IXR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM178BQ8IXR5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM178BQ8IXR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM178BQ8IXR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms