Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC117Q8IWD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC117Q8IWD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC117Q8IWD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms