Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRLF3Q8IUI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRLF3Q8IUI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRLF3Q8IUI8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRLF3Q8IUI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRLF3Q8IUI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRLF3Q8IUI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRLF3Q8IUI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLF3Q8IUI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms