Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29P2Q8IUI4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29P2Q8IUI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms