Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS6Q8IU80 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms