Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GATAD2AQ86YP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATAD2AQ86YP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms