Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM50Q86XT4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM50Q86XT4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM50Q86XT4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms