Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB4Q86W47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB4Q86W47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB4Q86W47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms