Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRX1Q86UT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRX1Q86UT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms